Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的代码

  • 更新时间:2020-06-18 09:21:28
  • 编辑:钱阳飙
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参考资料

正文内容

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小,拍摄日期等等,那么如何可视化图像呢?

import cv2
import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
image =sitk.ReadImage(path)
image = sitk.GetArrayFromImage(image)
#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer
plt.imshow(image,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()
cv2.imwrite('1.png',image)

这里path是mhd文件的路径,并且在该路径下需要有相应的raw文件

这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法

在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装

pip install opencv-python 
pip install SimpleITK

以上这篇Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持码农之家。

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