Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的代码
- 更新时间:2020-06-18 09:21:28
- 编辑:钱阳飙
参考资料
- 《Python编程实战:运用设计模式、并发和程序库创建高质量程序》中英对照表 配套资源 / 8.1 MB / Mark Summerfield 推荐度:
- Django实战:Python Web典型模块与项目开发 PDF 电子书 / 58 MB / 张晓 推荐度:
- 《Python数据科学指南》配套资源 配套资源 / 88.35 KB / 印度 Gopi Subramanian 推荐度:
- Python机器学习(第2版) PDF 电子书 / 59.6 MB / 塞巴斯蒂安·拉施 推荐度:
- Python编程入门(第3版) PDF 电子书 / 3285 MB MB / TobyDonaldson,袁国忠 推荐度:
正文内容
Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法
mhd格式的文件里面包含的是raw图像的一些头信息,比如图片大小,拍摄日期等等,那么如何可视化图像呢?
import cv2 import SimpleITK as sitk import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np image =sitk.ReadImage(path) image = sitk.GetArrayFromImage(image) #image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer plt.imshow(image,cmap='gray') plt.axis('off') plt.show() cv2.imwrite('1.png',image)
这里path是mhd文件的路径,并且在该路径下需要有相应的raw文件
这里展示一下我的mdk文件和保存的png文件
在这里如果cv2和ITK模块没有的话可以用pip安装
pip install opencv-python pip install SimpleITK
以上这篇Python可视化mhd格式和raw格式的医学图像并保存的方法就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持码农之家。
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