R并行编程实战 PDF 原书清晰版

本站精选了一篇R语言相关的资料，由机械工业出版社出版，作者是查普尔，介绍了关于R并行、R编程、R语言方面，格式为PDF，资源大小17.5 MB，目前在R语言类资源综合评分为：7.6分。

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书籍介绍

读者评价

本书针对那些想要超越单线程和内存限制的R程序员，使其从中学习如何实现高效大规模算法，这是对大数据高性能处理的必要条件。

有一定的实用性，可以用来入门学习R并行

内容介绍

本书是一本构建大规模高效算法的综合性实用书籍，介绍各种并行技术，从R语言的并行版本lapply()的简单应用到基于Hadoop和ApacheSpark框架的高级AWS云。在本书的后，你将了解到影响并行效率的因素，包括：评估代码性能和实现负载平衡；要避免的陷阱，包括死锁和数值不稳定问题；对于你的项目，如何为适合的并行类型构建代码和数据；如何在各种计算机系统中运行R代码获取佳性能。本书针对那些想要超越单线程和内存限制的R程序员，使其从中学习如何实现高效大规模算法，这是对大数据高性能处理的必要条件。

目录

• 译者序
• 前言
• 关于作者
• 第1章　简单的R并行性1
• 1.1　亚里士多德数谜2
• 1.1.1　求解程序的实现2
• 1.1.2　改进求解程序6
• 1.1.3　将问题分解为多个任务10
• 1.2　R的并行包14
• 1.2.1　使用mclapply()15
• 1.2.2　使用parLapply()19
• 1.2.3　并行负载均衡21
• 1.3　segue包23
• 1.3.1　安装segue24
• 1.3.2　设置AWS账户25
• 1.3.3　运行segue27
• 1.3.4　求解亚里士多德数谜32
• 1.4　总结34
• 第2章　消息传递入门36
• 2.1　为MPI设置系统环境36
• 2.1.1　为MPI选择R包37
• 2.1.2　选择MPI子系统37
• 2.1.3　安装OpenMPI38
• 2.2　MPI标准39
• 2.2.1　MPI的世界39
• 2.2.2　安装Rmpi40
• 2.2.3　安装pbdMPI41
• 2.3　MPI API43
• 2.3.1　点对点阻塞通信44
• 2.3.2　点对点非阻塞通信56
• 2.3.3　集体通信60
• 2.4　总结65
• 第3章　高级消息传递66
• 3.1　网格并行性66
• 3.1.1　创建网格集群68
• 3.1.2　边界数据交换70
• 3.1.3　中值滤波73
• 3.1.4　平铺分配图像74
• 3.1.5　中值滤波网格程序76
• 3.2　检查和管理通信84
• 3.3　lapply()的函数变体87
• 3.4　总结89
• 第4章　开发SPRINT—超级计算机的基于MPI的R包90
• 4.1　关于ARCHER91
• 4.2　从R中调用MPI代码92
• 4.2.1　MPI Hello World92
• 4.2.2　从R中调用C94
• 4.3　建立一个MPI R包—SPRINT97
• 4.3.1　简单的并行R接口（SPRINT）包97
• 4.3.2　SPRINT包的体系结构99
• 4.4　将一个新函数添加到SPRINT包中100
• 4.4.1　下载SPRINT源代码101
• 4.4.2　在R中创建一个存根—phello.R102
• 4.4.3　添加接口函数—phello.c103
• 4.4.4　添加实现函数—hello.c105
• 4.4.5　连接存根、接口和实现106
• 4.4.6　编译并运行SPRINT代码110
• 4.5　基因组学分析案例研究112
• 4.5.1　基因组学113
• 4.5.2　基因组数据115
• 4.6　基因组学与超级计算机116
• 4.6.1　目标116
• 4.6.2　ARCHER超级计算机116
• 4.6.3　随机森林120
• 4.6.4　基因组分析案例研究的数据122
• 4.6.5　ARCHER中的随机森林性能122
• 4.6.6　排名产品127
• 4.6.7　ARCHER中的排名产品性能128
• 4.6.8　结论131
• 4.7　总结132
• 第5章　笔记本中的超级计算机133
• 5.1　OpenCL133
• 5.2　ROpenCL包142
• 5.2.1　ROpenCL编程模型142
• 5.2.2　距离矩阵示例153
• 5.3　总结161
• 第6章　并行程序设计的艺术162
• 6.1　理解并行效率163
• 6.1.1　加速比163
• 6.1.2　阿姆达尔定律164
• 6.1.3　并行或者不并行165
• 6.2　数值逼近167
• 6.3　随机数170
• 6.4　死锁172
• 6.5　减少并行开销175
• 6.6　自适应负载均衡178
• 6.6.1　任务场178
• 6.6.2　有效的网格处理179
• 6.6.3　成功并行化的3个步骤180
• 6.6.4　未来将会怎样181
• 6.6.5　混合并行性184
• 6.7　总结185

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